Os eventos da peça acontecem no Egito, na cidade de Alexandria, no final do reinado da XIII dinastia, em 48 aC. As legiões de César entram no Egito. A cidade está em pânico. A rainha Cleópatra, uma menina de dezesseis anos, desapareceu. Eles não podem encontrá-la em lugar nenhum.
Nesse momento, Júlio César, sozinho, no deserto passa por uma pequena cópia da Esfinge e vê Cleópatra dormindo no peito de uma estátua de pedra. Ela acorda, diz que é a rainha do Egito e convida César, a quem ela chama de "velho", a subir nela e também se esconder dos romanos. Cleópatra está loucamente com medo deles. César admite que é romano e diz que se uma garota faz tudo como ele diz, César não a ofenderá. Cleópatra promete se tornar seu escravo e obedecê-lo em tudo. Então eles furtivamente fazem o seu caminho através do deserto para o palácio.
Cleópatra é extremamente tímida no palácio. Ela tem medo de dar ordens ao escravo, treme diante de sua babá Ftatatita. César a ensina a se comportar de maneira real, a comandar e se forçar a obedecer. Cleópatra está gostando e já sonha em "alimentar" seus escravos com veneno e jogá-los no Nilo para serem despedaçados por crocodilos. César pede que ela não se empolgue. No entanto, ela ainda tem muito medo de César. Quando os soldados romanos entram no palácio, cumprimentando a pessoa ao seu lado com as palavras: “Glória a César!”, Cleópatra repentinamente entende o assunto, e com alívio, soluçando, cai em seus braços.
O czar Ptolomeu Dionísio (menino de dez anos, irmão de Cleópatra e seu rival) e seu guardião Potin entram no salão inferior do palácio. Eles são acompanhados por Teodoto, mentor do rei, Aquiles, seu líder militar e cortesãos. Ptolomeu, no prompt de Potin, tenta expressar sua insatisfação com a invasão de César e o comportamento de Cleópatra. César entra na sala, acompanhado pelo oficial romano Ruthius e sua secretária, britânica, britânica de nacionalidade, vestida de azul. César não está inclinado a derramar sangue no Egito, mas exige que ele receba parte da quantia que o Egito deveria dar a Roma, de acordo com o antigo acordo entre César e o ex-rei do Egito, pelo fato de César ter ajudado a restaurar o trono. Cleópatra, que decidiu agir como uma rainha, corre para o irmão, puxa-o para fora do trono e ela se senta em seu lugar. César, tocado pelo desgosto do garoto, acalma-o gentilmente.
Os cortesãos egípcios e os líderes militares exigem que César deixe suas terras, mas ele responde que só fará isso depois que Cleópatra se tornar rainha. Ele permite que todos os egípcios se retirem, para a grande indignação de seus associados, e adverte que ele não será capaz de conter Rute e seus soldados por um longo tempo, e aqueles ansiosos para arrancar espadas da bainha. Potin lamenta amargamente a justiça romana, a falta de gratidão nos romanos. César está perdido. Ele não entende o que está em jogo. Então Potin pede a Lucius Septimius para sair, que diz que matou o republicano Pompeu, que queria derrotar César. César está surpreso, ele está horrorizado com o crime de Lúcio Septímio.
Os egípcios estão saindo. César fica com Cleópatra, que o censura com sensibilidade excessiva. Ela também conta como seu pai conseguiu recuperar o trono. E ele foi ajudado por um jovem bonito que chegou de Roma com muitos cavaleiros. Cleópatra tinha apenas doze anos e se apaixonou por esse jovem. Ela fica muito surpresa quando César nos diz que foi ele quem enviou Mark Anthony para ajudar seu pai. César promete a ela que, se ela desejar, ele enviará a ela.
César ordena que Rutius queime vários navios romanos que estão no porto ocidental e pegue todos os barcos que estão no porto oriental e capture Faros, uma ilha com um farol. Potin chega a César e vai lhe expressar as exigências dos egípcios. Desta vez, César o captura. Então Theodotus se apressa e, com extrema emoção, relata que o fogo dos navios romanos se espalhou para a Biblioteca Alexandria, o santo dos santos da civilização egípcia. César o aconselha a pedir ajuda para extinguir o fogo de Aquiles e seu exército. (Portanto, ele planeja desviar a atenção de Aquiles da captura da ilha de Faros pelos romanos.) César veste sua armadura e sai para participar da captura de Faros. Cleópatra implora para ele ter cuidado.
Após a partida de César no aterro, onde estão os guardas romanos, Apolodoro, um amante da arte da Sicília, patrício, aparece. Ele traz tapetes persas para o palácio, querendo que Cleópatra escolha alguns deles. A própria rainha sai correndo do palácio. Ela quer entrar imediatamente em um barco e navegar para César. No entanto, o guarda não permite que ela faça isso. Isso é contrário à ordem de César. Então Cleópatra pede a Apolodoro de barco que entregue a César um belo tapete persa como presente e obtenha permissão para ela navegar para a ilha para ele. Ela corre para pegar um tapete. Logo, os carregadores carregam um presente do palácio, colocam-no em um barco e Apolodoro sai da praia. Quando o barco já está longe da guarda, Ftatatita informa sarcasticamente que ele sentiu falta de Cleópatra, já que ela entrou no barco, enrolada em um tapete.
Um barco está navegando em direção à ilha. Nesse momento, alguém joga uma sacola pesada na água, o nariz do barco quebra e ele afunda. Apolodorus mal consegue tirar o tapete da água. Enquanto César, britânico e Rufius observavam com entusiasmo Apolodoro e seu fardo, os egípcios desembarcaram na praia. Os romanos e Cleópatra só sabem nadar. César nada carregando Cleópatra nas costas. Logo, um barco se aproxima deles e eles se movem a bordo.
Os seguintes eventos ocorrem em 47 de março, ou seja, seis meses após os eventos iniciais. Potin, ainda sendo mantido em cativeiro por César e morando no palácio, procura uma audiência com Cleópatra e, durante o qual ela se comporta de maneira submissa e respeitosa, às vezes tenta formar a rainha contra César, mas Cleópatra o afasta. Ele vai a César e está ansioso para restaurá-lo contra Cleópatra, mas não tem tempo para fazer isso, porque a própria rainha entra, indo jantar com César, Apolodoro e Rúcio. César pede a Potin para dizer o que ele queria dizer ou sair, pois ele lhe dará liberdade. Potin, depois de alguma confusão, começa a inspirá-lo que Cleópatra quer reinar sozinha no Egito e com todo o seu coração aguarda a partida dele. Cleópatra, indignada, afirma que isso é uma mentira. César, no entanto, acha que, mesmo que fosse assim, seria bastante natural. Ele pede a Potin para sair e repete que ele está livre. Cleópatra fervilha de raiva e silenciosamente ordena que Ftatite mate Potin antes que ele deixe o palácio. No almoço, todos de repente ouvem um grito e o som de um corpo caindo. Lucius Septimius entra e informa a César que Potin foi morto e a cidade enlouqueceu porque Potin era o favorito dos habitantes da cidade. Cleópatra confessa que mandou matar Potin por sua calúnia. Rufius e Apolodoro aprovam seu ato. No entanto, César diz que agora ele não será capaz de proteger a vida da rainha dos egípcios irados. Lucius Septimius o tranquiliza. Ele relata que os reforços chegaram aos romanos - o exército de Mitrídates de Pérgamo. César vai encontrar-se com Mitrídates. Antes de partir, Ruthius apunhala discretamente Ftatatita como uma tigresa selvagem que pode atacar a qualquer momento, enquanto depois explica seu ato a César. Ele o aprova. As tropas romanas esmagam os egípcios, o rei Ptolomeu se afoga no rio e Cleópatra se torna o governante soberano.
César está se preparando para navegar para Roma. Antes de deixar o Egito, ele deixa Rufius como governador. Para Cleópatra, ele reitera sua promessa de enviar Mark Anthony.